本题考查的是概念的关系。题目中，菱形是四边形的一种，二者是真包含关系，四边形真包含菱形。B项中，白萝卜是萝卜的一种，萝卜真包含白萝卜，二者的逻辑关系也是真包含关系，与题目中概念关系相同。综上所述，B项正确。

A项，西红柿也叫番茄，二者是同一个事物，因此二者的逻辑关系为全同关系。与题干中的概念的关系不一致，排除。

C项，花菜和黄花菜是两种不同的蔬菜，因此二者的逻辑关系为全异关系。与题干中的概念的关系不一致，排除。

D项，金针菇是蘑菇的一种，金针菇真包含于蘑菇，因此二者的逻辑关系为真包含于关系。与题干中的概念的关系不一致，排除。

因此，本题正确答案为B。